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常見(jiàn)問(wèn)題解答

樣本準備、包裝、保存和運輸指南
1 樣本準備應該遵循的基本原則
1.1 代表性原則
取樣的代表性關(guān)系到實(shí)驗結果是否具有科學(xué)意義,因此您應該根據實(shí)驗目的慎重選擇您的取樣方案。病變組織樣本中應不夾帶正常組織,正常組織樣本中不能含有病變組織。有條件時(shí),應做到實(shí)驗組與對照組的樣本在取材時(shí)間、部位、處理條件等方面盡可能保持一致,否則可能會(huì )影響實(shí)驗結果的可信度。
1.2 準確性原則
代表性樣本的各種特征數據必須被準確記錄,并按要求(低溫、迅速)采集、制備、貯存、運輸,最終正確地按實(shí)驗設計進(jìn)行實(shí)驗和數據處理。
1.3 迅速性原則
樣本質(zhì)量是實(shí)驗中影響實(shí)驗結果的最關(guān)鍵因素,因此樣本在采集、制備、貯存、
運輸過(guò)程中應盡可能地做到迅速,最大限度的縮短從樣本采集到實(shí)驗的時(shí)間。
1.4 低溫原則
所取樣本離體后,應盡快置于液氮、干冰或-80℃冰箱中,并保證在實(shí)驗前始
終處于-70℃以下,以避免DNA/RNA的降解。
2 樣本準備的方法
2.1 貼壁細胞
2.1.1RNA
2.1.1.1 貼壁細胞培養誘導結束后,去除培養液;
2.1.1.2 加入適量的PBS緩沖液沖洗一次,徹底去除PBS緩沖液
2.1.1.3 按每10 cm2 (相當于六孔板一個(gè)孔或35mm直徑培養皿)細胞加
1mL TRIzol 試劑的比例加入TRIzol 試劑;
2.1.1.4 使用玻璃滴管(或移液器Tip頭)反復吹打細胞,直至看不見(jiàn)成團的
細胞塊,使之充分溶解于TRIzol 中形成清亮不粘稠的液體;
2.1.1.5 將TRIzol液體全部轉移到RNase-free 的試管中
2.1.1.6 放入-80℃冰箱中保存。
2.1.2miRNA
2.1.2.1 貼壁細胞培養誘導結束后,去除培養液;
2.1.2.2 加入適量的PBS緩沖液沖洗一次,徹底去除PBS緩沖液;
2.1.2.3 按每105-107的細胞加入600μl Lysis/Binding Solution(我公司可免
費提供);
2.1.2.4 使用移液器Tip頭反復吹打細胞,直至看不見(jiàn)成團的細胞塊,使之充
分溶解于裂解液中形成清亮不粘稠的液體;
2.1.2.5 將液體全部轉移到RNase-free 的試管中;
2.1.2.6 放入-80℃冰箱中保存。
2.1.3 DNA
2.1.3.1 胰酶消化并收集約1-4×106細胞(60mm培養皿或T25培養瓶),轉
移到1.5ml離心管中;
2.1.3.2 3000rpm離心5min,去胰酶;
2.1.3.3 PBS輕輕吹打清洗一次。 3000rpm離心5min,去上清;
2.1.3.4 放入-80℃冰箱中保存。
2.1.4蛋白
2.1.4.1 貼壁細胞培養誘導結束后,去除培養液;
2.1.4.2 加入適量的PBS緩沖液沖洗一次,徹底去除PBS緩沖液
2.1.4.3 按六孔板一個(gè)孔或35mm直徑培養皿細胞加200µL TRIzol 試劑的比例加入RIPA 試劑;
2.1.4.4 使用玻璃滴管(或移液器Tip頭)反復吹打細胞,直至看不見(jiàn)成團的細胞塊,使之充分溶解于RIPA中形成清亮不粘稠的液體;
2.1.4.5 將液體全部轉移到離心管中;
2.1.4.6 放入-80℃冰箱中保存。
2.2 懸浮細胞
2.2.1RNA
2.2.1.1 懸浮細胞培養誘導結束后,去除培養液;
2.2.1.2 保留的細胞用PBS 緩沖液快速洗一次,離心除去PBS 緩沖液;
2.2.1.3 按照每5×106 個(gè)細胞加1 mL TRIzol 的比例加入TRIzol 試劑,使用
玻璃滴管(或移液器Tip頭)反復吹打細胞直至看不見(jiàn)成團的細胞
塊,使之充分溶解于TRIzol 中形成清亮不粘稠的液體;
2.2.1.4 放入-80℃冰箱中保存。
2.2.2miRNA
2.2.2.1 懸浮細胞培養誘導結束后,去除培養液;
2.2.2.2 保留的細胞用PBS 緩沖液快速洗一次,離心除去PBS 緩沖液;
2.2.2.3 按照每105-107的細胞加入600μl Lysis/Binding Solution(我公司可免費提供);
2.2.2.4 使用移液器Tip頭反復吹打細胞,直至看不見(jiàn)成團的細胞塊,使之充分溶解于裂解液中形成清亮不粘稠的液體;
2.2.2.5 將液體全部轉移到RNase-free 的試管中;
2.2.2.6 放入-80℃冰箱中保存。
2.2.3DNA
2.2.3.1 收集約1-4×106細胞(60mm培養皿或T25培養瓶),轉移到1.5ml離心管中;
2.2.3.2 3000rpm離心5min;
2.2.3.3 PBS輕輕吹打清洗一次。 3000rpm離心5min,去上清;
2.2.3.4 放入-80℃冰箱中保存。
2.2.4蛋白
2.2.4.1 貼壁細胞培養誘導結束后,去除培養液;
2.2.4.2 加入適量的PBS緩沖液沖洗一次,徹底去除PBS緩沖液
2.2.4.3 按六孔板一個(gè)孔或35mm直徑培養皿細胞加200µL TRIzol 試劑的比例加入RIPA 試劑;
2.2.4.4 使用玻璃滴管(或移液器Tip頭)反復吹打細胞,直至看不見(jiàn)成團的細胞塊,使之充分溶解于RIPA中形成清亮不粘稠的液體;
2.2.4.5 將液體全部轉移到離心管中;
2.2.4.6 放入-80℃冰箱中保存。
2.3 全血
2.3.1RNA
2.3.1.1 抽提RNA建議采用BD的PAXgene管抽取全血。使用淋巴細胞分離液或紅細胞裂解液會(huì )使活細胞處于應激狀態(tài),從而影響細胞的基因表達;
2.3.1.2 PAXgene管抽取全血;
2.3.1.3 采血以后,顛倒混勻8-10次;
2.3.1.4 4℃放置過(guò)夜后轉入-20℃或-80℃冰箱中保存。
2.3.2 DNA
2.3.2.1 用EDTA抗凝管抽取1-2ml全血;
2.3.2.2 顛倒混勻抗凝管8-10次,充分混勻EDTA和全血,保證抗凝效果;
2.3.2.3 放入-20℃冰箱中保存。
2.4 血漿
2.4.1 采集外周血2mL,迅速轉入EDTA抗凝管中,渦旋或用移液器Tip混勻;
2.4.2 在1小時(shí)(室溫條件下)或2小時(shí)(4℃條件下)內進(jìn)行下面的操作: 4℃,820g(9,400rpm)離心10分鐘;
2.4.3 吸約1mL上清轉至潔凈的1.5 mL離心管中,16,000g (13,200rpm),4℃,離心10分鐘,小心吸取上清到新的離心管中;
2.4.4 放入-80℃冰箱中保存。
2.5血清
2.5.1采集外周血2mL,迅速轉入促凝管中,渦旋或用移液器Tip混勻;
2.5.2 放入冰箱4℃條件下凝固4h,4℃,3000rpm離心10分鐘;
2.5.3 將上清轉至潔凈的1.5 mL離心管中,16,000g (13,200rpm),4℃,離心10分鐘,小心吸取上清到新的離心管中;
2.5.4 放入-80℃冰箱中保存。
2.6 動(dòng)物組織
2.6.1 RNA, miRNA、 DNA、蛋白和病例檢測
2.6.1.1首先準備好用于包裝樣本冷凍保存管,并且用油性記號筆在凍存管外表多處寫(xiě)明樣本編號;
2.6.1.2動(dòng)物取材時(shí):
病理樣本:10%福爾馬林的全身灌流,沖出待檢測樣本中的血液;
電鏡樣本:用生理鹽水全身灌流,沖出待檢測樣本中的血液;
RNA, miRNA、 DNA、蛋白檢測樣本:用生理鹽水全身灌流,沖出待檢測樣本中的血液;
準確切除所需組織后,立即剔除結締組織和脂肪組織等非研究所需的組織。務(wù)必將組織分割成小塊;
2.6.1.3 在生理鹽水或PBS中迅速漂洗樣本,以去除血漬和污物;
2.6.1.4 用鑷子夾住樣本,放入液氮中冷卻樣本(病理檢測的組織需置入4%多聚甲醛固定,電鏡樣本置于2.5%的戊二醛4℃固定);
2.6.1.5 放入準備好的保存管中根據實(shí)驗目的不同條件保存;
2.6.1.6 填寫(xiě)樣本登記單,寫(xiě)明樣本名稱(chēng)、組織類(lèi)型、編號、取樣日期、樣本處理過(guò)程等情況。
2.7 臨床組織標本
2.7.1RNA, miRNA、 DNA、蛋白和病理檢測
2.7.1.1 首先準備好用于包裝樣本冷凍保存管,并且用油性記號筆在凍存管外表多處寫(xiě)明樣本編號;
2.7.1.2 準確切除所需組織后,立即剔除非研究所需的組織,并將組織分割成小塊;
2.7.1.3 用鑷子夾住樣本,放入液氮中冷卻樣本(病理檢測的組織需置入4%多聚甲醛固定,電鏡樣本置于2.5%的戊二醛4℃固定);
2.7.1.4 放入準備好的保存管中根據實(shí)驗目的不同條件保存;
2.7.1.5 填寫(xiě)樣本登記單,寫(xiě)明樣本名稱(chēng)、組織類(lèi)型、編號、取樣日期、樣本處理過(guò)程等情況。
3 樣本包裝
3.1 注意事項
3.1.1在包裹樣本的鋁箔或冷凍保存管表面,用油性記號筆標明樣本編號及樣本
類(lèi)型。并且不要與乙醇等有機溶劑接觸。
3.1.2不要用紗布、紙張、一次性手套直接包裹樣本,而是用鋁箔或冷凍保存管包裹后再裝入樣本袋中。
3.1.3不要用玻璃容器在液氮中保存樣本;樣本包裝中不要使用透明膠帶。
3.1.4不要把標簽紙或其他紙制的說(shuō)明性文件放入樣本袋內,因為紙張在液氮中
是易碎的。
3.1.5標簽紙應該貼于樣本袋繩上,不要貼于容器表面以免脫落造成樣本混亂。
3.1.6不要在一只樣本袋中放過(guò)多的樣本,以防無(wú)法放入液氮罐或無(wú)法從液氮罐
中取出。樣本袋在使用前先在液氮中預冷。
3.1.7客戶(hù)在填寫(xiě)《樣本登記單》時(shí)應當詳細描述樣本的類(lèi)型、處理方法、儲存條件以及儲存時(shí)間等相關(guān)細節,以便技術(shù)人員確定合理的實(shí)驗方案。
4 樣本儲存
4.1 樣本冷凍儲存
4.1.1組織樣本采集后,樣本迅速放入進(jìn)口高質(zhì)量?jì)龃婀苤?,擰緊后立即放入液氮。然后再轉移到-80℃中保存。
4.1.2組織樣本儲存于液氮或-80℃冰箱中。對于液氮保存樣本,務(wù)必注意, 不要用Eppendorf管和國產(chǎn)凍存管,因為這些管子從液氮中取出時(shí)極易發(fā)生管子爆裂而造成樣本損失。
4.1.3細胞樣本經(jīng)Trizol或RIPA處理后儲存于-80℃冰箱中。在-20℃冰箱中儲存不宜太久。
4.1.4血液樣本建議使用PAXgene管(BD)保存。
4.1.5 RNA樣本儲存于-80℃冰箱中。
4.1.6 病理檢測樣本包好的蠟塊常溫保存;冰凍樣本在4%多聚甲醛固定24h,蔗糖梯度脫水(15%,30%),4℃保存運輸,最后OCT包埋;電鏡樣本米粒大1cm3待檢測樣本2.5%的戊二醛固定,4℃避光保存。
5 樣本運輸
5.1 干冰運輸
5.1.1飛機運輸干冰上限約為2公斤,超過(guò)2公斤原則上不能運輸?;疖?chē)運輸不受限制。
5.1.2干冰運輸應采用壁厚且質(zhì)量完好的泡沫箱,材料用編號后的凍存管存放,
用塑料袋包裝后埋入干冰中,泡沫箱應扣嚴并用封箱帶封嚴。外套紙殼箱包裝,以免碰裂。并標明輕取輕放提示,以保證安全運輸。
5.1.3干冰運輸可委托當地快遞公司,注意一定要確保48小時(shí)送達我方手中,不
能送貨上門(mén)的應提前通知我方。
5.1.4 24小時(shí)到達的,干冰數量不得低于5公斤; 48小時(shí)到達的,干冰數量不
低于8公斤。夏季可以適當再多增加部分干冰(平時(shí)的1.5倍)。超過(guò)48小時(shí)到達的,建議不要用此法運輸。
5.1.5運輸時(shí)可在干冰上再放一排液體冰袋。
5.1.6如委托快遞運輸,運輸過(guò)程中應隨時(shí)跟蹤貨物的情況,記錄貨單號,并保持與發(fā)出地和接收地的快遞公司的聯(lián)系。
5.2 冰袋(Gel Ice or Ice Pack
5.2.1如能確保樣本在24小時(shí)內到達本公司的,以下幾種類(lèi)型樣本可使用冰袋運
輸。
5.2.2保存于RNAlater中的組織樣本。
5.2.3保存于TRIzol中的細胞樣本或經(jīng)過(guò)勻漿的組織樣本。
5.2.4用于抽提DNA的新鮮抗凝全血樣本。
6 注意事項
6.1為確保實(shí)驗的順利,我們強烈建議您在取樣時(shí),應同時(shí)備份2~3份,如備3份,則送給我們兩份,如果備份2份,則送樣一份,您自己留一份,以防備部分樣本降解,重新取材或送樣耽誤您的時(shí)間。即使樣本全部合格,備份的樣本您還可以用來(lái)進(jìn)行其他方面的實(shí)驗(如定量驗證,蛋白方面,生化方面的實(shí)驗等)。
6.2備份又分為兩種,一種為嚴格備份,即:樣本取下后一分為二,這樣的兩份樣本基本上具備同性質(zhì)。另一種為非嚴格備份,即生物學(xué)重復的樣本,這樣的備份樣本同質(zhì)性要較前者差。

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