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RNA干擾(RNA interference, RNAi)是一種利用小RNA發(fā)夾結構來(lái)抑制基因表達的有效方法,在生物醫學(xué)研究中取得了重大進(jìn)展,特別是在通過(guò)干擾基因功能來(lái)解析基因型-表型關(guān)系方面。由于基于RNAi的工具和技術(shù)的激增,以及RNAi在需要瞬時(shí)基因敲除的特殊應用中的獨特優(yōu)勢,RNAi仍然是現代生物學(xué)家的一個(gè)重要研究工具。
盡管CRISPR/Cas9介導的基因編輯等新技術(shù)的發(fā)展,可能會(huì )使RNAi在特定應用中的效用黯然失色,但這項重要的技術(shù)仍然被廣泛使用,具有高度的適用性。RNAi是一種雙鏈RNA介導的機制,在轉錄后水平調控基因表達,其工作原理是將雙鏈RNA發(fā)夾結構加工成小干擾RNA (small interfering RNA, siRNA)或微RNA (microRNA/miRNA)。然后,這些小RNA與同源的mRNA結合,并通過(guò)RNA誘導沉默復合體(RNA induced silencing complex, RISC)誘導其降解。
miRNA的形成和調控機制
MicroRNA(miRNA)是一類(lèi)長(cháng)度為19-23nt的小型非編碼RNA,對植物和動(dòng)物的基因表達具有調節作用,最先在秀麗隱桿線(xiàn)蟲(chóng)中被發(fā)現,隨后被證明在人類(lèi)等高等脊椎動(dòng)物的基因組中編碼,以序列特異性方式作用于靶mRNA,以促進(jìn)其切割、降解或降低其翻譯效率。
miRNA的初級產(chǎn)物是pri-miRNA,它是一種至少包含一個(gè)發(fā)夾結構的長(cháng)RNA轉錄本,在細胞核內核糖核酸酶RNase III(即Drosha和DGCR8/Pasha)的作用下,生成前體miRNA(pre-miRNA)。隨后,pre-miRNA在Exportin-5復合物的作用下被轉運出細胞核,在細胞質(zhì)中由Dicer酶剪切成為成熟的miRNA。成熟的miRNAs可通過(guò)Argonaute蛋白質(zhì)家族與RISC結合,從而導致靶mRNA降解或翻譯抑制(圖1描述了miRNA的形成和調控機制)。
siRNA的形成和調控機制
Small interfering RNA(siRNA)是一種小的外源性dsRNA,包含約20個(gè)核苷酸,在體外RNA干擾(RNAi)過(guò)程中人工合成或通過(guò)轉運體從細胞核轉移到細胞質(zhì)中。在秀麗隱桿線(xiàn)蟲(chóng)中,dsRNA通過(guò)跨膜蛋白SID-1被轉移到細胞質(zhì)中,再經(jīng)DCR-1處理形成雙鏈siRNA。這些雙鏈siRNA與RISC結合形成小干擾RISC(small interfering RISC, siRISC),然后通過(guò)解旋酶作用激活siRISC。隨后,激活的siRISC以序列特異性的方式作用于靶mRNA,導致互補靶mRNA降解,從而抑制翻譯過(guò)程(圖1描述了siRNA的形成和調控機制)。
miRNA和siRNA之間既有相似之處,比如長(cháng)度均約為20個(gè)核苷酸,都由dsRNA產(chǎn)生,由Dicer酶切割參與RNAi過(guò)程。但二者也有許多不同之處,比如miRNA是單鏈小RNA,通過(guò)抑制翻譯而不是影響轉錄穩定性來(lái)調節基因表達,而siRNA是雙鏈小RNA,通過(guò)在轉錄后水平上降解靶mRNA來(lái)調節基因表達等
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